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事实不清证据不足案件怎么办？
证据不足，怎么结案的问题，分侦查阶段、审查起诉阶段、审判阶段不同的三种情况。 在侦查阶段，依据《刑事诉讼法》的规定，在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件；犯罪嫌疑人已被逮捕的，应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院。在审查起诉阶段，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。 犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十五条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。不起诉的决定，应当公开宣布，并且将不起诉决定书送达被不起诉人和他的所在单位。如果被不起诉人在押，应当立即释放。在审判阶段，在人民法院宣告判决前，人民检察院发现证据不足或证据发生变化，不符合起诉条件的，可以撤回起诉。对于撤回起诉的案件，人民检察院应当在撤回起诉后三十日以内作出不起诉决定。需要重新侦查的，应当在作出不起诉决定后将案卷材料退回公安机关，建议公安机关重新侦查并书面说明理由。法律规定：《刑事诉讼法》第一百六十一条 在侦查过程中，发现不应对犯罪嫌疑人追究刑事责任的，应当撤销案件；犯罪嫌疑人已被逮捕的，应当立即释放，发给释放证明，并且通知原批准逮捕的人民检察院。《刑事诉讼法》第一百七十一条 对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。《刑事诉讼法》第一百七十三条 犯罪嫌疑人没有犯罪事实，或者有本法第十五条规定的情形之一的，人民检察院应当作出不起诉决定。《刑事诉讼法》第一百七十四条 不起诉的决定，应当公开宣布，并且将不起诉决定书送达被不起诉人和他的所在单位。如果被不起诉人在押，应当立即释放。对于审查起诉阶段经过两次补偵仍事实不清的案子，能不能起诉？
这个问题嘛，理论上是可以的。
因为不少省份都有明文规定，除非是酌定不起诉不能开无犯罪起诉，其他种类的不起诉都可以开具无犯罪记录证明。
检察院以事实不清、证据不足作出不起诉决定，就是证据不足不起诉，也叫做存疑不起诉。
犯罪记录有哪些？所谓犯罪记录，是指人民法院作出
有罪
生效判决和裁定，以及检察机关作出相对不起诉决定的：包括管制、拘役、有期徒刑、无期徒刑、剥夺政治权利、免予刑事处罚等。
不包括 拘传、取保候审、监视居住、刑事拘留、逮捕等刑事强制措施。也就是说，犯罪记录，大部分要有法院的生效裁判，如果仅仅是取保候审、拘留、逮捕等，不能算作犯罪记录。
例外：相对不起诉也会被算作犯罪记录但是，有一个例外，如果是检察院作出了
相对
不起诉的决定，在某些省市，则也会被算作犯罪记录，什么是相对不起诉？即行为人行为已构成犯罪，但犯罪情节轻微，由检察机关作出不起诉决定的。相对不起诉是与绝对不起诉相对应的，所谓绝对不起诉，包括犯罪嫌疑人没有犯罪事实、情节显著轻微，危害不大，不认为是犯罪，犯罪已过追诉时效期限的，还包括证据不足、经过两次补充侦查，依然认为证据不足的，都属于绝对不起诉的情形。而检察院因为事实不清、证据不足，属于证据不足不起诉，也不是相对不起诉，是不会纳入犯罪记录的事项的。
监视居住到期，起诉，检察院因事实不清，证据不足不予批捕，公安局还能怎么做？
可以继续侦查，继续监视居住，可继续监视居住至期限届满，如果期满检察院仍不批捕，解除监视居住措施，相关法条，《刑事诉讼法》
第九十条公安机关对人民检察院不批准逮捕的决定，认为有错误的时候，可以要求复议，但是必须将被拘留的人立即释放。如果意见不被接受，可以向上一级人民检察院提请复核。上级人民检察院应当立即复核，作出是否变更的决定，通知下级人民检察院和公安机关执行。
第七十七条人民法院、人民检察院和公安机关对犯罪嫌疑人、被告人取保候审最长不得超过十二个月，监视居住最长不得超过六个月。
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